近日，中山大学副校长、我院胃肠病学研究所所长兰平教授和胃肠病学研究所副所长左涛研究员团队于国际病毒学知名杂志Journal of Medical Virology (IF=12.7, Q1) 发表题为“baseline gut microbiome features prior to SARS-CoV-2 infection are associated with host symptoms in and post COVID-19”的研究文章，文章具体揭示了新冠前基线肠道菌群水平与病毒感染后人体症状表现及后遗症的关联性，有助于进一步探究利用肠道菌群抗病毒感染的可行性。
每个人的肠道内寄居了超过40万亿的细菌，由它们组成的肠道菌群，对人们的免疫力、消化和代谢等方面产生重要影响，与我们的生活和健康息息相关，因此肠道菌群也被称为“第二大脑”。但不同人群不同个体之间，其基线肠道菌群存在巨大的差异，故而对人体对疾病的易感性影响也相差甚远。
既往研究报道，肠道菌群与个体感染新型冠状病毒（SARS-CoV-2，下述简称“新冠”）后的疾病严重程度显著相关。但由于缺乏患者感染新冠前的基线肠道菌群信息，现有的研究不能进一步探讨菌群是如何先验性地调控相关症状的，也不能阐明有哪些菌群在相关症状的调控中扮演了重要的角色。基于这一科学问题，我院兰平、左涛团队进行了一项探索性的、关于微生物组-COVID-19的纵向研究（新冠感染前后随访）。
首先，研究团队提出假设：在稳态下，基线肠道菌群巨大的异质性可能会使得个体的免疫力和对病毒的易感性有较大的差异，并在遇到病毒感染（例如 SARS-CoV-2感染）时介导机体产生不同的免疫反应和症状。为了验证这一假设，团队招募了国内不同区域的年轻健康志愿者，组成了一个高质量高度均质化的队列。项目在志愿者感染新冠前，采集了所有志愿者的粪便样本，并提取其中的肠道菌群作为基线数据，并在志愿者自然感染新冠后对其进行随访，以评估他们感染新冠后的相关症状及后遗症表现。
研究结果表明，个体的基线肠道微菌群特征与其感染新冠后的不同症状反应，特别是胃肠道受累和延绵存续的后遗症，呈现出以个体和人群依赖性的、错综复杂的相关性。更重要的是，该研究首次提出稳态下的基线肠道菌群可能会导致个体抵御呼吸道病毒感染的能力存在显著差异。
人体基线肠道菌群与感染新冠后症状和新冠后遗症的相关性
研究发现，新冠感染后症状不严重的个体中，肠道菌 Ruminococcus callidus 的含量相对丰富，而新冠感染后症状相对严重的个体中，肠道菌Bacilli bacterium, Veillonella tobetsuensis, and Eubacterium sp NSJ 61的含量相对丰富。此外，4中Streptococcus属的肠菌与新冠后症状的强度和持续时长成正相关（尤其Streptococcus intermedius）。研究还发现，肠道中肠菌Fecalibacterium prausnitzii 的存在是新冠感染后消化道症状的保护性因素；当个体不存在Fecalibacterium prausnitzii时，容易产生新冠感染后消化道反应。
肠道菌群在新冠病毒感染易感性中的重要作用
我院在读博士生梁冠湛、黄子誉和曹智睿为研究论文的共同第一作者，兰平教授和左涛研究员为论文的共同通讯作者。
原文链接：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.29083
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